sample	chr	startpos	endpos	nMajor	nMinor
TCGA-VQ-A8E3	1	61735	37693988	2	1
TCGA-VQ-A8E3	1	37694146	47089617	1	1
TCGA-VQ-A8E3	1	47091149	47230163	3	1
TCGA-VQ-A8E3	1	47232373	47966797	1	1
TCGA-VQ-A8E3	1	47966860	48543158	1	0
TCGA-VQ-A8E3	1	48543342	57200611	1	1
TCGA-VQ-A8E3	1	57200937	57604668	1	0
TCGA-VQ-A8E3	1	57604997	58212131	1	1
TCGA-VQ-A8E3	1	58213659	58251779	1	0
TCGA-VQ-A8E3	1	58251802	62738324	1	1
TCGA-VQ-A8E3	1	62740930	62896419	1	0
TCGA-VQ-A8E3	1	62898142	86941348	1	1
TCGA-VQ-A8E3	1	86947747	87769970	1	0
TCGA-VQ-A8E3	1	87770251	93695053	1	1
TCGA-VQ-A8E3	1	93697256	95917695	1	0
TCGA-VQ-A8E3	1	95917731	111295948	1	1
TCGA-VQ-A8E3	1	111296652	111718054	2	1
TCGA-VQ-A8E3	1	111721327	146498620	1	1
TCGA-VQ-A8E3	1	146498838	159744218	3	1
TCGA-VQ-A8E3	1	159745879	160150874	2	1
TCGA-VQ-A8E3	1	160151421	161841016	3	1
TCGA-VQ-A8E3	1	161841948	177717567	2	1
TCGA-VQ-A8E3	1	177717715	184953069	1	1
TCGA-VQ-A8E3	1	184953113	213551069	2	0
TCGA-VQ-A8E3	1	213551536	214762466	1	0
TCGA-VQ-A8E3	1	214762511	249224388	2	0
TCGA-VQ-A8E3	2	12784	433258	3	1
TCGA-VQ-A8E3	2	433274	3439202	2	1
TCGA-VQ-A8E3	2	3439299	4093252	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	4093415	10986391	2	1
TCGA-VQ-A8E3	2	10986626	12002079	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	12002601	19854935	2	1
TCGA-VQ-A8E3	2	19855063	21674404	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	21674751	23229690	2	1
TCGA-VQ-A8E3	2	23230226	23934816	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	23936503	41903888	2	1
TCGA-VQ-A8E3	2	41905552	43474672	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	43483044	45969069	2	1
TCGA-VQ-A8E3	2	45969163	47952231	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	47952777	62495209	2	1
TCGA-VQ-A8E3	2	62496540	63264747	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	63295716	68222281	2	1
TCGA-VQ-A8E3	2	68222353	68933839	3	1
TCGA-VQ-A8E3	2	68933876	75504615	2	1
TCGA-VQ-A8E3	2	75504977	75906176	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	75906624	80247986	2	1
TCGA-VQ-A8E3	2	80248001	109990287	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	109992208	110072247	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	110075556	118926955	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	118927720	123044961	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	123045721	127375991	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	127376251	132339011	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	132339121	138452729	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	138453808	139065003	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	139065123	159436788	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	159437013	160094760	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	160095086	165232737	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	165235487	167398578	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	167398921	177586718	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	177586748	178748168	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	178748208	206343059	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	206343526	206833817	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	206833918	208233602	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	208236250	209376810	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	209376965	216205484	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	216205655	221084810	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	221085730	230587448	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	230587794	231690784	2	1
TCGA-VQ-A8E3	2	231697652	235383267	1	1
TCGA-VQ-A8E3	2	235383944	235991748	1	0
TCGA-VQ-A8E3	2	235991856	243089456	1	1
TCGA-VQ-A8E3	3	60345	409498	3	0
TCGA-VQ-A8E3	3	409515	4849596	2	0
TCGA-VQ-A8E3	3	4851248	8456221	3	0
TCGA-VQ-A8E3	3	8456286	8894856	2	0
TCGA-VQ-A8E3	3	8895825	10334981	3	0
TCGA-VQ-A8E3	3	10335145	11074013	2	0
TCGA-VQ-A8E3	3	11076597	12926633	3	0
TCGA-VQ-A8E3	3	12928548	13918381	2	0
TCGA-VQ-A8E3	3	13925440	21682079	3	0
TCGA-VQ-A8E3	3	21682494	42239701	3	1
TCGA-VQ-A8E3	3	42243851	57915474	1	1
TCGA-VQ-A8E3	3	57915479	58730533	1	0
TCGA-VQ-A8E3	3	58733748	60209681	1	1
TCGA-VQ-A8E3	3	60210372	60482952	1	0
TCGA-VQ-A8E3	3	60486890	60525325	0	0
TCGA-VQ-A8E3	3	60527479	60545602	1	0
TCGA-VQ-A8E3	3	60546244	90257834	1	1
TCGA-VQ-A8E3	3	90258929	112936609	2	1
TCGA-VQ-A8E3	3	112936907	113017317	1	1
TCGA-VQ-A8E3	3	113018599	122607469	2	1
TCGA-VQ-A8E3	3	122609206	129933318	1	1
TCGA-VQ-A8E3	3	129933648	132917246	2	1
TCGA-VQ-A8E3	3	132920098	134894679	1	1
TCGA-VQ-A8E3	3	134897700	195972380	2	1
TCGA-VQ-A8E3	3	195973244	196674879	3	1
TCGA-VQ-A8E3	3	196676432	197441584	2	1
TCGA-VQ-A8E3	3	197446887	197896118	3	2
TCGA-VQ-A8E3	4	12281	9867502	1	0
TCGA-VQ-A8E3	4	9868593	10383179	0	0
TCGA-VQ-A8E3	4	10384116	49590656	1	0
TCGA-VQ-A8E3	4	49620885	76672398	2	1
TCGA-VQ-A8E3	4	76675802	78121478	1	0
TCGA-VQ-A8E3	4	78123574	79491844	0	0
TCGA-VQ-A8E3	4	79493223	88293630	1	0
TCGA-VQ-A8E3	4	88293745	89255263	0	0
TCGA-VQ-A8E3	4	89266038	165849854	1	0
TCGA-VQ-A8E3	4	165854123	166950575	0	0
TCGA-VQ-A8E3	4	166953052	191027923	1	0
TCGA-VQ-A8E3	5	15532	620279	3	1
TCGA-VQ-A8E3	5	620486	38936631	2	1
TCGA-VQ-A8E3	5	38938325	40832682	2	2
TCGA-VQ-A8E3	5	40833013	49879098	2	1
TCGA-VQ-A8E3	5	49881117	55115198	2	0
TCGA-VQ-A8E3	5	55115528	55897825	1	0
TCGA-VQ-A8E3	5	55897856	68028864	2	0
TCGA-VQ-A8E3	5	68029471	74370000	1	0
TCGA-VQ-A8E3	5	74370768	77799193	2	0
TCGA-VQ-A8E3	5	77799233	80834138	1	0
TCGA-VQ-A8E3	5	80834229	94572738	2	0
TCGA-VQ-A8E3	5	94572930	96481475	1	0
TCGA-VQ-A8E3	5	96483480	131286289	2	0
TCGA-VQ-A8E3	5	131286925	135667410	1	0
TCGA-VQ-A8E3	5	135667783	148306272	2	0
TCGA-VQ-A8E3	5	148306566	151023610	1	0
TCGA-VQ-A8E3	5	151024052	167204175	2	0
TCGA-VQ-A8E3	5	167204469	168736303	1	0
TCGA-VQ-A8E3	5	168737450	171763663	2	0
TCGA-VQ-A8E3	5	171764120	173647452	1	0
TCGA-VQ-A8E3	5	173648583	180108853	2	0
TCGA-VQ-A8E3	5	180109638	180790320	3	0
TCGA-VQ-A8E3	6	149661	886884	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	887482	1670732	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	1670985	3232772	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	3233433	5248728	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	5251307	10823292	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	10825471	11852651	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	11852838	14665413	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	14665517	15315880	3	0
TCGA-VQ-A8E3	6	15317128	32268429	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	32268488	33124693	3	0
TCGA-VQ-A8E3	6	33125312	41718915	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	41719110	42858905	3	0
TCGA-VQ-A8E3	6	42861798	51778076	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	51778897	52918904	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	52921493	88043402	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	88043560	89358077	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	89358533	107120530	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	107120782	108066144	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	108069833	110627919	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	110628330	110921917	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	110924988	131564149	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	131564492	132599026	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	132599819	142213183	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	142213252	143922335	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	143925374	147901981	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	147902709	147956944	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	147957296	155228435	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	155229025	156312369	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	156313930	157450400	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	157454495	158847367	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	158848333	167487011	2	0
TCGA-VQ-A8E3	6	167494397	170619361	1	0
TCGA-VQ-A8E3	6	170619840	171051005	2	0
TCGA-VQ-A8E3	7	43259	181104	3	2
TCGA-VQ-A8E3	7	181654	7399417	2	2
TCGA-VQ-A8E3	7	7401939	9280001	3	2
TCGA-VQ-A8E3	7	9283620	47250136	2	1
TCGA-VQ-A8E3	7	47250231	48017590	1	0
TCGA-VQ-A8E3	7	48018104	61987323	2	1
TCGA-VQ-A8E3	7	62014325	80305418	2	2
TCGA-VQ-A8E3	7	80306271	85090477	3	2
TCGA-VQ-A8E3	7	85092117	104260081	2	2
TCGA-VQ-A8E3	7	104260121	105723807	2	1
TCGA-VQ-A8E3	7	105723910	107333347	3	1
TCGA-VQ-A8E3	7	107338003	134842858	2	1
TCGA-VQ-A8E3	7	134843589	135057146	1	1
TCGA-VQ-A8E3	7	135063391	136626840	2	1
TCGA-VQ-A8E3	7	136628299	154406581	2	0
TCGA-VQ-A8E3	7	154406965	158407675	1	0
TCGA-VQ-A8E3	7	158410592	159127004	2	0
TCGA-VQ-A8E3	8	31254	813394	1	1
TCGA-VQ-A8E3	8	814492	1633653	1	0
TCGA-VQ-A8E3	8	1633695	11251175	1	1
TCGA-VQ-A8E3	8	11252170	13726783	1	0
TCGA-VQ-A8E3	8	13726907	16864671	1	1
TCGA-VQ-A8E3	8	16867375	17643238	1	0
TCGA-VQ-A8E3	8	17643254	19226335	1	1
TCGA-VQ-A8E3	8	19227933	19982484	2	1
TCGA-VQ-A8E3	8	19983859	26967549	1	1
TCGA-VQ-A8E3	8	26969601	28227332	1	0
TCGA-VQ-A8E3	8	28227346	62168429	1	1
TCGA-VQ-A8E3	8	62170957	62670686	1	0
TCGA-VQ-A8E3	8	62676530	96174164	1	1
TCGA-VQ-A8E3	8	96175435	99490897	1	0
TCGA-VQ-A8E3	8	99490911	128478160	1	1
TCGA-VQ-A8E3	8	128479490	129987170	1	0
TCGA-VQ-A8E3	8	129987558	139424987	1	1
TCGA-VQ-A8E3	8	139425111	140963276	1	0
TCGA-VQ-A8E3	8	140963581	142342557	1	1
TCGA-VQ-A8E3	8	142342682	145033734	1	0
TCGA-VQ-A8E3	8	145037573	146298155	2	1
TCGA-VQ-A8E3	9	46587	417448	2	2
TCGA-VQ-A8E3	9	417477	593899	2	1
TCGA-VQ-A8E3	9	596826	14111172	1	1
TCGA-VQ-A8E3	9	14111873	14310933	1	0
TCGA-VQ-A8E3	9	14319509	19828235	1	1
TCGA-VQ-A8E3	9	19828904	32903329	1	0
TCGA-VQ-A8E3	9	32903442	103774489	1	1
TCGA-VQ-A8E3	9	103774859	104555236	1	0
TCGA-VQ-A8E3	9	104555316	116715753	1	1
TCGA-VQ-A8E3	9	116716505	117237867	1	0
TCGA-VQ-A8E3	9	117242599	140489637	1	1
TCGA-VQ-A8E3	9	140493694	141091394	2	2
TCGA-VQ-A8E3	10	72759	818851	3	2
TCGA-VQ-A8E3	10	819904	1789659	2	1
TCGA-VQ-A8E3	10	1789882	4833418	2	2
TCGA-VQ-A8E3	10	4834556	5722311	2	1
TCGA-VQ-A8E3	10	5724382	10699168	3	2
TCGA-VQ-A8E3	10	10699419	26220821	2	1
TCGA-VQ-A8E3	10	26221227	28825689	3	1
TCGA-VQ-A8E3	10	28832915	60461450	2	1
TCGA-VQ-A8E3	10	60462041	61178458	1	1
TCGA-VQ-A8E3	10	61178813	71392279	2	1
TCGA-VQ-A8E3	10	71392692	71723414	1	1
TCGA-VQ-A8E3	10	71727888	79529215	2	1
TCGA-VQ-A8E3	10	79529245	81223714	1	0
TCGA-VQ-A8E3	10	81226434	87685741	2	1
TCGA-VQ-A8E3	10	87688537	89263372	1	1
TCGA-VQ-A8E3	10	89263722	90962279	3	1
TCGA-VQ-A8E3	10	90962421	123807240	2	1
TCGA-VQ-A8E3	10	123808342	124465540	1	1
TCGA-VQ-A8E3	10	124470089	130069115	2	1
TCGA-VQ-A8E3	10	130074063	134126679	1	1
TCGA-VQ-A8E3	10	134128076	135506704	2	1
TCGA-VQ-A8E3	11	198572	13401607	2	0
TCGA-VQ-A8E3	11	13402409	13871737	3	0
TCGA-VQ-A8E3	11	13875513	19477994	2	0
TCGA-VQ-A8E3	11	19478468	20273243	1	0
TCGA-VQ-A8E3	11	20274656	56881328	2	0
TCGA-VQ-A8E3	11	56881365	57293791	1	0
TCGA-VQ-A8E3	11	57295864	70261143	2	0
TCGA-VQ-A8E3	11	70261778	71303996	1	0
TCGA-VQ-A8E3	11	71326953	86146001	2	0
TCGA-VQ-A8E3	11	86150865	86736891	1	0
TCGA-VQ-A8E3	11	86740256	111098277	2	0
TCGA-VQ-A8E3	11	111098908	111362832	1	0
TCGA-VQ-A8E3	11	111363161	114877677	2	0
TCGA-VQ-A8E3	11	114878065	117569726	1	0
TCGA-VQ-A8E3	11	117570851	119501021	2	0
TCGA-VQ-A8E3	11	119503516	120206662	1	0
TCGA-VQ-A8E3	11	120211212	124578282	2	0
TCGA-VQ-A8E3	11	124582314	127124975	1	0
TCGA-VQ-A8E3	11	127125166	134944770	2	0
TCGA-VQ-A8E3	12	150442	1548864	3	1
TCGA-VQ-A8E3	12	1550764	34428945	2	1
TCGA-VQ-A8E3	12	34434976	39770648	1	1
TCGA-VQ-A8E3	12	39781158	41426867	1	0
TCGA-VQ-A8E3	12	41431769	48093284	1	1
TCGA-VQ-A8E3	12	48102096	48411102	1	0
TCGA-VQ-A8E3	12	48411827	75400882	1	1
TCGA-VQ-A8E3	12	75401890	76577838	1	0
TCGA-VQ-A8E3	12	76578372	113480566	1	1
TCGA-VQ-A8E3	12	113482176	116109223	1	0
TCGA-VQ-A8E3	12	116109900	124783210	1	1
TCGA-VQ-A8E3	12	124784606	126106560	1	0
TCGA-VQ-A8E3	12	126107480	130437044	1	1
TCGA-VQ-A8E3	12	130437429	133402944	1	0
TCGA-VQ-A8E3	12	133403334	133778189	2	1
TCGA-VQ-A8E3	13	19026949	30946291	3	0
TCGA-VQ-A8E3	13	30946446	31289980	4	0
TCGA-VQ-A8E3	13	31290090	46103342	3	0
TCGA-VQ-A8E3	13	46103666	46510333	2	0
TCGA-VQ-A8E3	13	46510514	75721413	3	0
TCGA-VQ-A8E3	13	75721472	76521634	2	0
TCGA-VQ-A8E3	13	76521824	98413631	3	0
TCGA-VQ-A8E3	13	98414063	99505632	2	0
TCGA-VQ-A8E3	13	99506418	110752672	3	0
TCGA-VQ-A8E3	13	110753403	113860439	2	0
TCGA-VQ-A8E3	13	113860587	115108397	3	0
TCGA-VQ-A8E3	14	19002124	53803052	1	1
TCGA-VQ-A8E3	14	53803578	55935618	1	0
TCGA-VQ-A8E3	14	55939377	70331469	1	1
TCGA-VQ-A8E3	14	70331657	70658939	1	0
TCGA-VQ-A8E3	14	70658956	75476139	1	1
TCGA-VQ-A8E3	14	75479644	76392963	2	1
TCGA-VQ-A8E3	14	76393968	94167174	1	1
TCGA-VQ-A8E3	14	94169774	95108387	1	0
TCGA-VQ-A8E3	14	95108797	107285437	1	1
TCGA-VQ-A8E3	15	20016328	102469040	2	0
TCGA-VQ-A8E3	16	60777	4908956	2	1
TCGA-VQ-A8E3	16	4909314	23734151	1	1
TCGA-VQ-A8E3	16	23735791	24213587	2	2
TCGA-VQ-A8E3	16	24214060	78895565	1	1
TCGA-VQ-A8E3	16	78900591	79120294	1	0
TCGA-VQ-A8E3	16	79123576	84115279	1	1
TCGA-VQ-A8E3	16	84115302	85166733	2	1
TCGA-VQ-A8E3	16	85170117	88793337	1	1
TCGA-VQ-A8E3	16	88797628	90287535	2	1
TCGA-VQ-A8E3	17	526	10565963	3	0
TCGA-VQ-A8E3	17	10566035	44115886	2	0
TCGA-VQ-A8E3	17	44116238	47941873	3	0
TCGA-VQ-A8E3	17	47942375	56437932	2	0
TCGA-VQ-A8E3	17	56440542	59419945	3	0
TCGA-VQ-A8E3	17	59421778	59598599	1	0
TCGA-VQ-A8E3	17	59600468	63523603	3	0
TCGA-VQ-A8E3	17	63525082	70793410	2	0
TCGA-VQ-A8E3	17	70794462	81049726	3	0
TCGA-VQ-A8E3	18	48133	644790	4	0
TCGA-VQ-A8E3	18	646075	7456671	3	0
TCGA-VQ-A8E3	18	7460379	9004771	3	2
TCGA-VQ-A8E3	18	9005535	9860978	4	1
TCGA-VQ-A8E3	18	9861155	15402408	3	1
TCGA-VQ-A8E3	18	18529353	21046198	1	1
TCGA-VQ-A8E3	18	21051362	25076215	2	1
TCGA-VQ-A8E3	18	25089301	34820988	1	0
TCGA-VQ-A8E3	18	34822703	35355763	0	0
TCGA-VQ-A8E3	18	35356575	36453199	1	0
TCGA-VQ-A8E3	18	36458253	38710003	2	0
TCGA-VQ-A8E3	18	38714443	54663448	1	0
TCGA-VQ-A8E3	18	54665772	56541943	0	0
TCGA-VQ-A8E3	18	56543957	78015057	1	0
TCGA-VQ-A8E3	19	90910	6524708	2	2
TCGA-VQ-A8E3	19	6525600	7506942	3	3
TCGA-VQ-A8E3	19	7518212	16033937	3	2
TCGA-VQ-A8E3	19	16034015	27751675	2	2
TCGA-VQ-A8E3	19	27762138	36752991	2	0
TCGA-VQ-A8E3	19	36756852	38282158	4	0
TCGA-VQ-A8E3	19	38282360	54901920	3	0
TCGA-VQ-A8E3	19	54902331	57622994	2	2
TCGA-VQ-A8E3	19	57623283	57867905	3	3
TCGA-VQ-A8E3	19	57870147	59097854	3	0
TCGA-VQ-A8E3	20	61305	230541	8	0
TCGA-VQ-A8E3	20	230556	5918994	6	0
TCGA-VQ-A8E3	20	5920873	12729815	5	0
TCGA-VQ-A8E3	20	12729860	13390908	4	0
TCGA-VQ-A8E3	20	13391002	22197253	5	0
TCGA-VQ-A8E3	20	22197686	26231808	4	0
TCGA-VQ-A8E3	20	26231998	43460346	3	0
TCGA-VQ-A8E3	20	43461442	44408428	4	0
TCGA-VQ-A8E3	20	44409565	46858627	3	0
TCGA-VQ-A8E3	20	46858654	55531305	4	0
TCGA-VQ-A8E3	20	55533577	61758917	3	0
TCGA-VQ-A8E3	20	61763504	62956153	4	0
TCGA-VQ-A8E3	21	10736871	18385997	1	0
TCGA-VQ-A8E3	21	18386761	47463227	1	1
TCGA-VQ-A8E3	21	47465171	48096957	2	1
TCGA-VQ-A8E3	22	16052528	51234455	2	0
TCGA-VQ-A8E3	X	168477	689546	1	1
TCGA-VQ-A8E3	X	693930	10505697	1	0
TCGA-VQ-A8E3	X	10507080	10651753	0	0
TCGA-VQ-A8E3	X	10657787	154459642	1	0
TCGA-VQ-A8E3	X	154460154	155233846	2	0
