sample	chr	startpos	endpos	nMajor	nMinor
TCGA-AQ-A54N	1	61735	2617141	2	2
TCGA-AQ-A54N	1	2617926	23163835	2	1
TCGA-AQ-A54N	1	23166289	23388753	3	1
TCGA-AQ-A54N	1	23390135	23922813	2	1
TCGA-AQ-A54N	1	23930125	25620629	2	2
TCGA-AQ-A54N	1	25627926	25940206	2	1
TCGA-AQ-A54N	1	25940769	26174553	3	1
TCGA-AQ-A54N	1	26178265	37467750	2	1
TCGA-AQ-A54N	1	37472740	39731119	2	2
TCGA-AQ-A54N	1	39732915	65912823	2	1
TCGA-AQ-A54N	1	65917061	66450959	2	2
TCGA-AQ-A54N	1	66454749	67439525	2	1
TCGA-AQ-A54N	1	67440389	67675678	3	2
TCGA-AQ-A54N	1	67676042	121741181	2	1
TCGA-AQ-A54N	1	143285278	149761074	4	1
TCGA-AQ-A54N	1	149761178	150765897	10	1
TCGA-AQ-A54N	1	150766223	182753608	5	1
TCGA-AQ-A54N	1	182759752	183326795	5	2
TCGA-AQ-A54N	1	183329015	189601864	5	1
TCGA-AQ-A54N	1	189603241	214464465	2	1
TCGA-AQ-A54N	1	214465093	214709640	2	2
TCGA-AQ-A54N	1	214710240	222484862	2	1
TCGA-AQ-A54N	1	222519278	230459091	5	1
TCGA-AQ-A54N	1	230461250	238592081	7	1
TCGA-AQ-A54N	1	238592496	246792676	5	1
TCGA-AQ-A54N	1	246793626	247780974	4	4
TCGA-AQ-A54N	1	247781066	248930189	5	1
TCGA-AQ-A54N	2	12784	9484424	4	1
TCGA-AQ-A54N	2	9484665	10000523	5	2
TCGA-AQ-A54N	2	10000867	11303322	5	1
TCGA-AQ-A54N	2	11303444	11600051	5	2
TCGA-AQ-A54N	2	11601031	24771576	5	1
TCGA-AQ-A54N	2	24771701	25280074	7	1
TCGA-AQ-A54N	2	25284768	37045704	5	1
TCGA-AQ-A54N	2	37049802	38296400	2	1
TCGA-AQ-A54N	2	38300366	38728724	7	1
TCGA-AQ-A54N	2	38729805	46756102	2	1
TCGA-AQ-A54N	2	46758786	46955625	2	2
TCGA-AQ-A54N	2	46956567	96168311	2	1
TCGA-AQ-A54N	2	96170774	98021041	4	1
TCGA-AQ-A54N	2	98022050	150483026	2	1
TCGA-AQ-A54N	2	150488470	151775389	2	2
TCGA-AQ-A54N	2	151776167	184845858	2	1
TCGA-AQ-A54N	2	184854447	185909328	3	1
TCGA-AQ-A54N	2	185912891	242147305	2	1
TCGA-AQ-A54N	3	18667	12806000	2	0
TCGA-AQ-A54N	3	12806478	12919221	4	0
TCGA-AQ-A54N	3	12920743	90436812	2	0
TCGA-AQ-A54N	3	90453712	98384580	2	2
TCGA-AQ-A54N	3	98389526	100393310	5	2
TCGA-AQ-A54N	3	100403780	122886260	2	2
TCGA-AQ-A54N	3	122886697	124194703	4	2
TCGA-AQ-A54N	3	124195344	141987302	2	2
TCGA-AQ-A54N	3	141991196	142387917	5	2
TCGA-AQ-A54N	3	142390288	150591866	2	2
TCGA-AQ-A54N	3	150597457	151172092	3	2
TCGA-AQ-A54N	3	151174490	192069092	2	2
TCGA-AQ-A54N	3	192069523	193276496	5	2
TCGA-AQ-A54N	3	193280492	198169247	2	2
TCGA-AQ-A54N	4	12281	1117806	2	1
TCGA-AQ-A54N	4	1118731	1418224	2	2
TCGA-AQ-A54N	4	1422631	84922568	2	1
TCGA-AQ-A54N	4	84926251	87205474	5	1
TCGA-AQ-A54N	4	87207953	91510458	2	1
TCGA-AQ-A54N	4	91511060	92728368	5	1
TCGA-AQ-A54N	4	92729468	113708681	2	1
TCGA-AQ-A54N	4	113710191	114651317	3	2
TCGA-AQ-A54N	4	114654823	116974036	2	1
TCGA-AQ-A54N	4	116976502	117724642	5	1
TCGA-AQ-A54N	4	117725156	139975199	2	1
TCGA-AQ-A54N	4	139975399	140370123	5	1
TCGA-AQ-A54N	4	140377455	152787147	2	1
TCGA-AQ-A54N	4	152795365	153051202	3	1
TCGA-AQ-A54N	4	153051658	153323801	4	2
TCGA-AQ-A54N	4	153327754	154158235	2	2
TCGA-AQ-A54N	4	154158615	172644870	2	1
TCGA-AQ-A54N	4	172645613	173488577	3	1
TCGA-AQ-A54N	4	173490316	181281346	2	1
TCGA-AQ-A54N	4	181281568	181863568	2	2
TCGA-AQ-A54N	4	181868461	190106768	2	1
TCGA-AQ-A54N	5	15532	3220235	2	2
TCGA-AQ-A54N	5	3221295	4912174	5	2
TCGA-AQ-A54N	5	4912197	14526399	2	2
TCGA-AQ-A54N	5	14526746	16980083	3	2
TCGA-AQ-A54N	5	16991802	28309847	2	2
TCGA-AQ-A54N	5	28316550	28572749	5	2
TCGA-AQ-A54N	5	28575008	43253956	2	2
TCGA-AQ-A54N	5	43256343	43608985	5	2
TCGA-AQ-A54N	5	43609170	50136997	2	2
TCGA-AQ-A54N	5	50146124	50872680	2	0
TCGA-AQ-A54N	5	50872763	50948272	4	0
TCGA-AQ-A54N	5	50952337	115898395	2	0
TCGA-AQ-A54N	5	115903019	116035385	4	0
TCGA-AQ-A54N	5	116035574	137341664	2	0
TCGA-AQ-A54N	5	137348414	138103145	4	0
TCGA-AQ-A54N	5	138106078	138850700	6	0
TCGA-AQ-A54N	5	138853022	170547480	2	0
TCGA-AQ-A54N	5	170551254	170878599	4	0
TCGA-AQ-A54N	5	170879080	181363319	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	149661	4682784	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	4684603	5339942	4	0
TCGA-AQ-A54N	6	5360700	18187685	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	18187696	18324404	5	0
TCGA-AQ-A54N	6	18324489	42310806	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	42312552	45879409	3	0
TCGA-AQ-A54N	6	45879882	58448438	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	60351931	61531101	4	0
TCGA-AQ-A54N	6	61531247	62250735	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	62251614	63413672	4	0
TCGA-AQ-A54N	6	63415580	70643226	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	70652051	70973311	15	3
TCGA-AQ-A54N	6	70973448	71111816	7	2
TCGA-AQ-A54N	6	71115460	73042233	2	2
TCGA-AQ-A54N	6	73042287	73288278	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	73290632	74521328	4	0
TCGA-AQ-A54N	6	74525443	75543180	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	75560563	75738903	4	0
TCGA-AQ-A54N	6	75744670	118272145	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	118278637	118324797	4	0
TCGA-AQ-A54N	6	118324853	125071169	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	125075263	125350687	5	0
TCGA-AQ-A54N	6	125350805	154190364	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	154190400	155619846	4	0
TCGA-AQ-A54N	6	155621680	160897178	2	0
TCGA-AQ-A54N	6	160899899	161876571	4	0
TCGA-AQ-A54N	6	161877319	170741917	2	0
TCGA-AQ-A54N	7	43259	47058719	2	0
TCGA-AQ-A54N	7	47059004	47059004	4	0
TCGA-AQ-A54N	7	47060234	47068639	2	0
TCGA-AQ-A54N	7	47072873	48158439	4	0
TCGA-AQ-A54N	7	48159502	57957538	2	0
TCGA-AQ-A54N	7	57960264	95123092	2	1
TCGA-AQ-A54N	7	95133405	97457422	3	1
TCGA-AQ-A54N	7	97457777	119363631	2	1
TCGA-AQ-A54N	7	119366808	120895284	2	0
TCGA-AQ-A54N	7	120900434	150666612	2	1
TCGA-AQ-A54N	7	150670669	151103652	2	2
TCGA-AQ-A54N	7	151104730	154565897	2	1
TCGA-AQ-A54N	7	154570984	155044734	4	1
TCGA-AQ-A54N	7	155048147	159334314	2	1
TCGA-AQ-A54N	8	81254	3593141	2	2
TCGA-AQ-A54N	8	3593535	4024690	2	1
TCGA-AQ-A54N	8	4024810	4182936	2	2
TCGA-AQ-A54N	8	4183441	4260114	2	0
TCGA-AQ-A54N	8	4263998	34266617	2	2
TCGA-AQ-A54N	8	34267290	35003064	5	2
TCGA-AQ-A54N	8	35004106	35333000	2	2
TCGA-AQ-A54N	8	35338899	35872067	5	2
TCGA-AQ-A54N	8	35875001	60264650	2	2
TCGA-AQ-A54N	8	60265103	61432234	5	2
TCGA-AQ-A54N	8	61432832	90210426	2	2
TCGA-AQ-A54N	8	90211332	91290493	5	2
TCGA-AQ-A54N	8	91295560	94078416	2	2
TCGA-AQ-A54N	8	94078557	94840421	5	2
TCGA-AQ-A54N	8	94845219	99614805	2	2
TCGA-AQ-A54N	8	99618408	99673555	7	0
TCGA-AQ-A54N	8	99684467	100994405	5	3
TCGA-AQ-A54N	8	100995473	115845790	2	2
TCGA-AQ-A54N	8	115847981	116265331	5	3
TCGA-AQ-A54N	8	116266503	118139520	2	2
TCGA-AQ-A54N	8	118140680	118323058	5	2
TCGA-AQ-A54N	8	118324332	118356277	4	0
TCGA-AQ-A54N	8	118356479	118364750	5	0
TCGA-AQ-A54N	8	118367001	123149740	2	0
TCGA-AQ-A54N	8	123150387	123922016	3	0
TCGA-AQ-A54N	8	123922096	127217460	2	0
TCGA-AQ-A54N	8	127219700	127445906	3	0
TCGA-AQ-A54N	8	127446064	127694474	7	0
TCGA-AQ-A54N	8	127694526	127854222	10	0
TCGA-AQ-A54N	8	127861303	145072769	2	0
TCGA-AQ-A54N	9	46587	34546367	4	0
TCGA-AQ-A54N	9	34550297	112616014	2	0
TCGA-AQ-A54N	9	112620973	112655611	4	0
TCGA-AQ-A54N	9	112656441	129447224	2	0
TCGA-AQ-A54N	9	129456606	130070290	3	0
TCGA-AQ-A54N	9	130073595	138200944	2	0
TCGA-AQ-A54N	10	26823	6287963	2	2
TCGA-AQ-A54N	10	6288034	8214067	4	2
TCGA-AQ-A54N	10	8215425	21161717	2	2
TCGA-AQ-A54N	10	21164868	21542761	4	2
TCGA-AQ-A54N	10	21543783	77468951	2	2
TCGA-AQ-A54N	10	77470343	79313758	4	2
TCGA-AQ-A54N	10	79314624	80049286	6	2
TCGA-AQ-A54N	10	80050732	86098083	2	2
TCGA-AQ-A54N	10	86098111	88401162	3	2
TCGA-AQ-A54N	10	88404194	88795000	5	3
TCGA-AQ-A54N	10	88795302	92038031	2	2
TCGA-AQ-A54N	10	92038855	92356920	5	3
TCGA-AQ-A54N	10	92357134	93267860	2	2
TCGA-AQ-A54N	10	93272300	93493523	4	3
TCGA-AQ-A54N	10	93498283	103604976	2	2
TCGA-AQ-A54N	10	103605424	105083761	4	2
TCGA-AQ-A54N	10	105086476	106163643	2	2
TCGA-AQ-A54N	10	106164611	106650584	5	2
TCGA-AQ-A54N	10	106650827	130970063	2	2
TCGA-AQ-A54N	10	130973107	132129125	4	2
TCGA-AQ-A54N	10	132129275	133769379	2	2
TCGA-AQ-A54N	11	198572	515931	1	1
TCGA-AQ-A54N	11	516520	1007226	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	1007257	12156246	1	1
TCGA-AQ-A54N	11	12160913	12296936	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	12297192	22295283	1	1
TCGA-AQ-A54N	11	22295363	22983437	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	22984200	48968103	1	1
TCGA-AQ-A54N	11	48969924	61720218	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	61727332	65320920	1	1
TCGA-AQ-A54N	11	65321027	65764182	5	2
TCGA-AQ-A54N	11	65769685	67224146	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	67226807	71213887	1	1
TCGA-AQ-A54N	11	71216379	71461212	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	71466576	77460604	1	1
TCGA-AQ-A54N	11	77460620	77750897	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	77755289	78315470	3	2
TCGA-AQ-A54N	11	78318661	78796745	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	78798302	82790340	1	1
TCGA-AQ-A54N	11	82791619	91517035	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	91518041	95033780	1	1
TCGA-AQ-A54N	11	95034183	95161799	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	95165647	114104204	1	1
TCGA-AQ-A54N	11	114104724	114292054	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	114293049	129307277	1	1
TCGA-AQ-A54N	11	129308772	129925934	2	1
TCGA-AQ-A54N	11	129929929	135074876	1	1
TCGA-AQ-A54N	12	51460	312242	2	1
TCGA-AQ-A54N	12	314648	1727199	4	1
TCGA-AQ-A54N	12	1731567	2918843	2	1
TCGA-AQ-A54N	12	2921560	3189911	2	2
TCGA-AQ-A54N	12	3192540	10938270	2	1
TCGA-AQ-A54N	12	10938952	11520212	4	1
TCGA-AQ-A54N	12	11520334	12118232	17	1
TCGA-AQ-A54N	12	12121684	12300874	10	1
TCGA-AQ-A54N	12	12301328	12900371	4	1
TCGA-AQ-A54N	12	12900556	24623710	2	1
TCGA-AQ-A54N	12	24626091	26218704	5	1
TCGA-AQ-A54N	12	26219545	53556784	2	1
TCGA-AQ-A54N	12	53557462	55142885	5	1
TCGA-AQ-A54N	12	55145375	79080668	2	1
TCGA-AQ-A54N	12	79081015	79557786	5	1
TCGA-AQ-A54N	12	79559977	121140647	2	1
TCGA-AQ-A54N	12	121140670	121796285	2	2
TCGA-AQ-A54N	12	121809376	122301968	5	1
TCGA-AQ-A54N	12	122305026	127640657	2	1
TCGA-AQ-A54N	12	127640713	128947412	2	2
TCGA-AQ-A54N	12	128948148	133201603	2	1
TCGA-AQ-A54N	13	18452809	24341939	2	0
TCGA-AQ-A54N	13	24347579	24493437	4	0
TCGA-AQ-A54N	13	24496142	37501828	2	0
TCGA-AQ-A54N	13	37502130	37540973	0	0
TCGA-AQ-A54N	13	37551050	49632742	2	0
TCGA-AQ-A54N	13	49649384	49908054	4	0
TCGA-AQ-A54N	13	49917827	114342922	2	0
TCGA-AQ-A54N	14	18225647	43270091	2	0
TCGA-AQ-A54N	14	43275503	44153114	4	0
TCGA-AQ-A54N	14	44160460	55244030	2	0
TCGA-AQ-A54N	14	55244956	55646022	4	0
TCGA-AQ-A54N	14	55648148	68257456	2	0
TCGA-AQ-A54N	14	68258851	68540588	3	0
TCGA-AQ-A54N	14	68540782	68926164	2	0
TCGA-AQ-A54N	14	68926311	69332102	4	0
TCGA-AQ-A54N	14	69334392	106877229	2	0
TCGA-AQ-A54N	15	19811075	48259257	2	0
TCGA-AQ-A54N	15	48260086	48622729	4	0
TCGA-AQ-A54N	15	48623353	63725124	2	0
TCGA-AQ-A54N	15	63725249	64374707	3	0
TCGA-AQ-A54N	15	64379137	72021972	2	0
TCGA-AQ-A54N	15	72029881	72293238	5	0
TCGA-AQ-A54N	15	72301613	77176677	2	0
TCGA-AQ-A54N	15	77177301	77596502	6	0
TCGA-AQ-A54N	15	77596582	83204044	2	0
TCGA-AQ-A54N	15	83205288	83389840	4	0
TCGA-AQ-A54N	15	83391838	84126857	2	0
TCGA-AQ-A54N	15	84127408	85975028	3	0
TCGA-AQ-A54N	15	85976009	101928837	2	0
TCGA-AQ-A54N	16	10777	299293	2	0
TCGA-AQ-A54N	16	301673	3370814	3	0
TCGA-AQ-A54N	16	3375325	6704929	2	0
TCGA-AQ-A54N	16	6705413	7563486	4	0
TCGA-AQ-A54N	16	7564080	9156315	2	0
TCGA-AQ-A54N	16	9162580	9591903	4	0
TCGA-AQ-A54N	16	9594198	23858385	2	0
TCGA-AQ-A54N	16	23861161	24081043	4	0
TCGA-AQ-A54N	16	24087206	70821299	2	0
TCGA-AQ-A54N	16	70821576	71168894	3	1
TCGA-AQ-A54N	16	71171291	90221127	2	0
TCGA-AQ-A54N	17	150733	8817967	4	0
TCGA-AQ-A54N	17	8818290	28699905	2	0
TCGA-AQ-A54N	17	28700426	29635210	4	0
TCGA-AQ-A54N	17	29635375	31934741	2	0
TCGA-AQ-A54N	17	31939909	32697619	4	0
TCGA-AQ-A54N	17	32702593	72979972	2	0
TCGA-AQ-A54N	17	72984148	74639767	4	0
TCGA-AQ-A54N	17	74639929	83090856	2	0
TCGA-AQ-A54N	18	48133	80257174	2	1
TCGA-AQ-A54N	19	90910	6835657	2	0
TCGA-AQ-A54N	19	6849895	7856044	4	0
TCGA-AQ-A54N	19	7861099	14854042	2	0
TCGA-AQ-A54N	19	14854980	16863168	5	0
TCGA-AQ-A54N	19	16867197	21254023	2	0
TCGA-AQ-A54N	19	21254354	21893126	2	2
TCGA-AQ-A54N	19	21893538	22645025	5	2
TCGA-AQ-A54N	19	22649783	38198231	2	2
TCGA-AQ-A54N	19	38214502	38831935	4	2
TCGA-AQ-A54N	19	38832397	58586487	2	2
TCGA-AQ-A54N	20	80664	7566971	1	1
TCGA-AQ-A54N	20	7567605	8081410	2	1
TCGA-AQ-A54N	20	8081707	19542520	1	0
TCGA-AQ-A54N	20	19542672	19792090	2	0
TCGA-AQ-A54N	20	19794574	22279352	1	0
TCGA-AQ-A54N	20	22285475	22755277	2	1
TCGA-AQ-A54N	20	22757416	26324943	1	0
TCGA-AQ-A54N	20	30185676	36434261	2	1
TCGA-AQ-A54N	20	36434888	37056247	2	2
TCGA-AQ-A54N	20	37068156	40786530	2	1
TCGA-AQ-A54N	20	40786682	42438031	2	2
TCGA-AQ-A54N	20	42438864	45102529	2	1
TCGA-AQ-A54N	20	45104374	45479295	5	1
TCGA-AQ-A54N	20	45481911	49866684	2	1
TCGA-AQ-A54N	20	49867086	51353566	4	1
TCGA-AQ-A54N	20	51355731	59737239	2	1
TCGA-AQ-A54N	20	59738022	60103609	3	1
TCGA-AQ-A54N	20	60106282	60613671	4	2
TCGA-AQ-A54N	20	60614880	60772492	3	1
TCGA-AQ-A54N	20	60772609	63207538	2	1
TCGA-AQ-A54N	20	63210908	64324800	3	2
TCGA-AQ-A54N	21	10336543	43833057	2	1
TCGA-AQ-A54N	21	43837231	44270876	2	2
TCGA-AQ-A54N	21	44271456	46677045	2	1
TCGA-AQ-A54N	22	15294545	18908788	2	0
TCGA-AQ-A54N	22	18917325	19651860	3	0
TCGA-AQ-A54N	22	19653185	20399949	2	0
TCGA-AQ-A54N	22	20400216	21663930	3	0
TCGA-AQ-A54N	22	21670026	22180382	5	0
TCGA-AQ-A54N	22	22180419	30453093	2	0
TCGA-AQ-A54N	22	30455968	30534188	4	0
TCGA-AQ-A54N	22	30544385	35850976	2	0
TCGA-AQ-A54N	22	35852316	36244581	3	0
TCGA-AQ-A54N	22	36248028	36572776	7	0
TCGA-AQ-A54N	22	36574997	37242577	2	0
TCGA-AQ-A54N	22	37246885	37311921	7	0
TCGA-AQ-A54N	22	37314254	38785591	3	0
TCGA-AQ-A54N	22	38785800	50796027	2	0
TCGA-AQ-A54N	X	251810	16462476	2	1
TCGA-AQ-A54N	X	16462535	17115983	3	1
TCGA-AQ-A54N	X	17115996	45220167	2	1
TCGA-AQ-A54N	X	45227573	50554470	3	1
TCGA-AQ-A54N	X	50555595	56176061	2	1
TCGA-AQ-A54N	X	56191906	57418269	6	1
TCGA-AQ-A54N	X	57425167	67095034	2	1
TCGA-AQ-A54N	X	67095603	69708898	2	0
TCGA-AQ-A54N	X	69712368	71575668	3	0
TCGA-AQ-A54N	X	71596599	71633675	6	0
TCGA-AQ-A54N	X	71634713	72686202	3	0
TCGA-AQ-A54N	X	72686957	108367794	2	0
TCGA-AQ-A54N	X	108367918	109120311	4	0
TCGA-AQ-A54N	X	109120979	109445262	12	0
TCGA-AQ-A54N	X	109448646	111295980	4	0
TCGA-AQ-A54N	X	111297275	129938142	2	0
TCGA-AQ-A54N	X	129942871	130604443	3	0
TCGA-AQ-A54N	X	130606911	135122116	2	0
TCGA-AQ-A54N	X	135162713	138569934	3	0
TCGA-AQ-A54N	X	138570090	156004181	2	0
