sample	chr	startpos	endpos	nMajor	nMinor
TCGA-AO-A03P	1	61735	121741181	2	1
TCGA-AO-A03P	1	143285278	248930189	3	3
TCGA-AO-A03P	2	12784	242147305	2	1
TCGA-AO-A03P	3	18667	51920711	3	1
TCGA-AO-A03P	3	51922371	94144163	4	1
TCGA-AO-A03P	3	94145163	96628127	3	0
TCGA-AO-A03P	3	96631049	96958373	3	1
TCGA-AO-A03P	3	96959965	98009931	3	0
TCGA-AO-A03P	3	98013923	98081307	10	3
TCGA-AO-A03P	3	98085199	98099979	16	1
TCGA-AO-A03P	3	98104785	103773743	3	0
TCGA-AO-A03P	3	103780034	104312708	4	1
TCGA-AO-A03P	3	104312739	105434827	9	3
TCGA-AO-A03P	3	105443414	106118110	4	1
TCGA-AO-A03P	3	106120488	106374883	7	4
TCGA-AO-A03P	3	106374964	163557031	3	0
TCGA-AO-A03P	3	163561227	163968459	3	3
TCGA-AO-A03P	3	163968695	164230932	4	1
TCGA-AO-A03P	3	164231314	166081664	4	2
TCGA-AO-A03P	3	166082129	166376401	23	3
TCGA-AO-A03P	3	166379405	169147953	3	0
TCGA-AO-A03P	3	169151324	169306720	8	4
TCGA-AO-A03P	3	169309139	169658502	4	2
TCGA-AO-A03P	3	169659948	169881653	4	0
TCGA-AO-A03P	3	169881779	172232874	3	3
TCGA-AO-A03P	3	172237287	174155654	3	0
TCGA-AO-A03P	3	174160311	174576127	4	4
TCGA-AO-A03P	3	174576707	176778425	3	0
TCGA-AO-A03P	3	176778748	177089526	9	4
TCGA-AO-A03P	3	177090983	177414638	4	0
TCGA-AO-A03P	3	177415494	177918905	5	2
TCGA-AO-A03P	3	177925733	178491791	4	0
TCGA-AO-A03P	3	178492932	178897134	4	3
TCGA-AO-A03P	3	178897425	191840817	3	0
TCGA-AO-A03P	3	191841418	192417456	4	4
TCGA-AO-A03P	3	192417870	192657611	19	2
TCGA-AO-A03P	3	192660578	192942453	4	1
TCGA-AO-A03P	3	192942929	193545226	4	2
TCGA-AO-A03P	3	193546918	193839769	3	0
TCGA-AO-A03P	3	193840293	194251028	4	1
TCGA-AO-A03P	3	194252860	198169247	4	0
TCGA-AO-A03P	4	12281	185654162	2	2
TCGA-AO-A03P	4	185655908	188592895	2	1
TCGA-AO-A03P	4	188594049	190106768	2	2
TCGA-AO-A03P	5	15532	16153783	2	2
TCGA-AO-A03P	5	16155007	16731721	3	2
TCGA-AO-A03P	5	16731943	46382550	2	2
TCGA-AO-A03P	5	46383233	51059481	2	1
TCGA-AO-A03P	5	51069217	51578422	2	2
TCGA-AO-A03P	5	51580699	52209831	4	2
TCGA-AO-A03P	5	52210004	61766798	2	2
TCGA-AO-A03P	5	61767775	62650721	2	1
TCGA-AO-A03P	5	62655589	181363319	2	2
TCGA-AO-A03P	6	149661	76913060	2	2
TCGA-AO-A03P	6	76913408	82962264	2	1
TCGA-AO-A03P	6	82967374	170741917	2	2
TCGA-AO-A03P	7	43259	86917110	2	2
TCGA-AO-A03P	7	86920369	87436106	2	1
TCGA-AO-A03P	7	87436371	159131377	2	2
TCGA-AO-A03P	7	159134958	159334314	3	1
TCGA-AO-A03P	8	81254	29672992	1	0
TCGA-AO-A03P	8	29674281	31647501	1	1
TCGA-AO-A03P	8	31649255	31848434	6	1
TCGA-AO-A03P	8	31848985	33490482	1	1
TCGA-AO-A03P	8	33492778	34069712	3	1
TCGA-AO-A03P	8	34073054	34327704	6	1
TCGA-AO-A03P	8	34328536	34498016	12	1
TCGA-AO-A03P	8	34510647	35071941	2	1
TCGA-AO-A03P	8	35077387	42144388	1	1
TCGA-AO-A03P	8	42145300	60492116	3	1
TCGA-AO-A03P	8	60492584	145072769	3	3
TCGA-AO-A03P	9	46587	9277158	2	2
TCGA-AO-A03P	9	9279132	9561872	2	1
TCGA-AO-A03P	9	9562067	138200944	2	2
TCGA-AO-A03P	10	26823	55443896	2	2
TCGA-AO-A03P	10	55444412	56115493	22	1
TCGA-AO-A03P	10	56115521	60026593	2	2
TCGA-AO-A03P	10	60027207	61957858	9	2
TCGA-AO-A03P	10	61962985	62583506	4	2
TCGA-AO-A03P	10	62589908	62918776	19	2
TCGA-AO-A03P	10	62918922	63454966	5	2
TCGA-AO-A03P	10	63458633	65160730	17	2
TCGA-AO-A03P	10	65161653	66204531	4	2
TCGA-AO-A03P	10	66204705	67433843	23	1
TCGA-AO-A03P	10	67450440	67763257	8	2
TCGA-AO-A03P	10	67763568	68408543	20	2
TCGA-AO-A03P	10	68410900	69111374	3	2
TCGA-AO-A03P	10	69111842	69838479	38	1
TCGA-AO-A03P	10	69838871	70434833	29	1
TCGA-AO-A03P	10	70436088	70772281	16	2
TCGA-AO-A03P	10	70773443	71577120	32	1
TCGA-AO-A03P	10	71577401	72067017	18	1
TCGA-AO-A03P	10	72071648	72494482	5	2
TCGA-AO-A03P	10	72496272	73130563	20	3
TCGA-AO-A03P	10	73130691	73437293	11	1
TCGA-AO-A03P	10	73438135	73438135	22	0
TCGA-AO-A03P	10	73439648	75261450	8	2
TCGA-AO-A03P	10	75266592	76447343	11	2
TCGA-AO-A03P	10	76447859	77023994	17	2
TCGA-AO-A03P	10	77029456	78111269	5	2
TCGA-AO-A03P	10	78111758	78520154	17	1
TCGA-AO-A03P	10	78521979	78579356	5	2
TCGA-AO-A03P	10	78582918	79431500	16	2
TCGA-AO-A03P	10	79437421	80050732	5	2
TCGA-AO-A03P	10	80051824	81633472	7	2
TCGA-AO-A03P	10	81637800	82769985	2	0
TCGA-AO-A03P	10	82770450	85419624	11	2
TCGA-AO-A03P	10	85419946	86116488	2	2
TCGA-AO-A03P	10	86120461	86246971	22	7
TCGA-AO-A03P	10	86248171	86601849	2	2
TCGA-AO-A03P	10	86602781	94789028	2	0
TCGA-AO-A03P	10	94795834	96362168	23	1
TCGA-AO-A03P	10	96362577	129208706	2	0
TCGA-AO-A03P	10	129212507	131371202	19	1
TCGA-AO-A03P	10	131371723	132329993	5	2
TCGA-AO-A03P	10	132336493	133365107	20	1
TCGA-AO-A03P	10	133366273	133769379	6	2
TCGA-AO-A03P	11	198572	37769486	3	1
TCGA-AO-A03P	11	37770009	40530194	5	3
TCGA-AO-A03P	11	40530296	42358057	3	3
TCGA-AO-A03P	11	42359529	58818171	3	2
TCGA-AO-A03P	11	58829437	59134079	2	1
TCGA-AO-A03P	11	59134290	61153052	2	0
TCGA-AO-A03P	11	61154458	62149604	2	2
TCGA-AO-A03P	11	62150041	62871439	2	0
TCGA-AO-A03P	11	62871779	66139024	2	2
TCGA-AO-A03P	11	66142658	66852333	2	0
TCGA-AO-A03P	11	66854879	68646570	2	2
TCGA-AO-A03P	11	68647188	69085565	2	0
TCGA-AO-A03P	11	69088015	71231578	3	2
TCGA-AO-A03P	11	71232256	135074876	2	0
TCGA-AO-A03P	12	51460	133201603	3	2
TCGA-AO-A03P	13	18452809	114342922	2	2
TCGA-AO-A03P	14	18225647	23616155	6	2
TCGA-AO-A03P	14	23621402	42186072	3	2
TCGA-AO-A03P	14	42186210	46847301	2	2
TCGA-AO-A03P	14	46849325	54141044	4	2
TCGA-AO-A03P	14	54146081	106877229	2	1
TCGA-AO-A03P	15	19811075	30038443	2	1
TCGA-AO-A03P	15	30039148	31128973	2	2
TCGA-AO-A03P	15	31129126	35651289	2	1
TCGA-AO-A03P	15	35651760	37520882	2	2
TCGA-AO-A03P	15	37521681	42533690	2	1
TCGA-AO-A03P	15	42538042	43437944	20	2
TCGA-AO-A03P	15	43444049	43467365	9	1
TCGA-AO-A03P	15	43467576	43602608	10	1
TCGA-AO-A03P	15	43603341	45177496	3	2
TCGA-AO-A03P	15	45179525	46950375	28	1
TCGA-AO-A03P	15	46953102	47282314	9	0
TCGA-AO-A03P	15	47282585	47937088	2	1
TCGA-AO-A03P	15	47943313	48968404	21	1
TCGA-AO-A03P	15	48968491	50864759	29	1
TCGA-AO-A03P	15	50866452	55936478	22	1
TCGA-AO-A03P	15	55954294	56736433	5	2
TCGA-AO-A03P	15	56740578	57588320	2	1
TCGA-AO-A03P	15	57588496	58134043	6	2
TCGA-AO-A03P	15	58135251	60436218	2	1
TCGA-AO-A03P	15	60439303	60723908	37	1
TCGA-AO-A03P	15	60723970	61190393	23	1
TCGA-AO-A03P	15	61191830	66987819	2	2
TCGA-AO-A03P	15	66989677	67370868	6	2
TCGA-AO-A03P	15	67370946	67389569	3	1
TCGA-AO-A03P	15	67389656	70063299	2	2
TCGA-AO-A03P	15	70065452	71653623	7	2
TCGA-AO-A03P	15	71655767	73531819	2	2
TCGA-AO-A03P	15	73536633	74324289	8	1
TCGA-AO-A03P	15	74326035	76327772	6	2
TCGA-AO-A03P	15	76328231	77178957	12	2
TCGA-AO-A03P	15	77180529	78161677	6	2
TCGA-AO-A03P	15	78162453	80294338	3	2
TCGA-AO-A03P	15	80299410	80658392	25	1
TCGA-AO-A03P	15	80659965	82742310	10	1
TCGA-AO-A03P	15	82742662	83679850	4	2
TCGA-AO-A03P	15	83680337	84755812	5	2
TCGA-AO-A03P	15	84759350	85274016	11	2
TCGA-AO-A03P	15	85274141	85475710	33	1
TCGA-AO-A03P	15	85478489	85512451	7	0
TCGA-AO-A03P	15	85513231	85585465	26	1
TCGA-AO-A03P	15	85585486	86305946	5	2
TCGA-AO-A03P	15	86311128	87070936	7	2
TCGA-AO-A03P	15	87074296	87497038	2	2
TCGA-AO-A03P	15	87497169	87897911	4	2
TCGA-AO-A03P	15	87901867	88873742	13	1
TCGA-AO-A03P	15	88875757	89742946	2	2
TCGA-AO-A03P	15	89744958	90232468	35	1
TCGA-AO-A03P	15	90233143	94321514	2	2
TCGA-AO-A03P	15	94321650	97189587	2	0
TCGA-AO-A03P	15	97198513	97538512	6	2
TCGA-AO-A03P	15	97539048	98213847	30	1
TCGA-AO-A03P	15	98218144	98977740	47	1
TCGA-AO-A03P	15	98978583	99264236	20	1
TCGA-AO-A03P	15	99267488	99623543	4	2
TCGA-AO-A03P	15	99627518	100924710	2	2
TCGA-AO-A03P	15	100927355	101625600	18	1
TCGA-AO-A03P	15	101626041	101928837	6	1
TCGA-AO-A03P	16	10777	6706688	3	2
TCGA-AO-A03P	16	6707809	7083247	2	1
TCGA-AO-A03P	16	7083289	55915075	2	2
TCGA-AO-A03P	16	55923749	90221127	2	1
TCGA-AO-A03P	17	150733	2937637	3	2
TCGA-AO-A03P	17	2938301	38452896	2	2
TCGA-AO-A03P	17	38452980	83090856	4	2
TCGA-AO-A03P	18	48133	24528799	2	2
TCGA-AO-A03P	18	24530923	24614727	19	2
TCGA-AO-A03P	18	24615034	24966551	9	1
TCGA-AO-A03P	18	24969487	25090638	18	1
TCGA-AO-A03P	18	25090800	25476461	5	2
TCGA-AO-A03P	18	25477748	26092815	3	2
TCGA-AO-A03P	18	26095501	27403417	19	1
TCGA-AO-A03P	18	27405402	28164790	25	1
TCGA-AO-A03P	18	28169131	29660742	8	2
TCGA-AO-A03P	18	29662035	41221234	14	1
TCGA-AO-A03P	18	41222085	47078774	15	3
TCGA-AO-A03P	18	47084132	47610731	9	3
TCGA-AO-A03P	18	47611802	80257174	6	3
TCGA-AO-A03P	19	90910	1808864	2	0
TCGA-AO-A03P	19	1809939	4394313	2	2
TCGA-AO-A03P	19	4406163	6943527	2	0
TCGA-AO-A03P	19	6950049	12550332	2	2
TCGA-AO-A03P	19	12550364	15375248	3	2
TCGA-AO-A03P	19	15393955	35327994	2	2
TCGA-AO-A03P	19	35329348	36843696	2	1
TCGA-AO-A03P	19	36847819	37403973	7	2
TCGA-AO-A03P	19	37404480	48289665	2	1
TCGA-AO-A03P	19	48294560	51032851	8	1
TCGA-AO-A03P	19	51038957	51878455	6	1
TCGA-AO-A03P	19	51878609	55992324	10	1
TCGA-AO-A03P	19	55996661	57055428	2	1
TCGA-AO-A03P	19	57056605	57201137	4	1
TCGA-AO-A03P	19	57201927	58492401	8	1
TCGA-AO-A03P	19	58492463	58586487	2	1
TCGA-AO-A03P	20	80664	26324943	5	2
TCGA-AO-A03P	20	30185676	33472933	2	1
TCGA-AO-A03P	20	33473905	33964781	2	0
TCGA-AO-A03P	20	33969366	34925930	2	1
TCGA-AO-A03P	20	34926662	35167652	13	2
TCGA-AO-A03P	20	35171451	37354486	2	1
TCGA-AO-A03P	20	37358250	38037680	5	2
TCGA-AO-A03P	20	38043212	39251884	2	1
TCGA-AO-A03P	20	39252839	39592113	2	0
TCGA-AO-A03P	20	39595705	39987501	4	3
TCGA-AO-A03P	20	39988328	41342239	7	2
TCGA-AO-A03P	20	41350585	42297384	5	2
TCGA-AO-A03P	20	42297485	43319272	3	3
TCGA-AO-A03P	20	43319396	44277283	6	2
TCGA-AO-A03P	20	44280325	44661030	3	2
TCGA-AO-A03P	20	44661200	46225459	2	0
TCGA-AO-A03P	20	46230226	46334801	2	1
TCGA-AO-A03P	20	46336653	46935803	11	2
TCGA-AO-A03P	20	46938867	47137690	2	2
TCGA-AO-A03P	20	47139737	47499326	13	2
TCGA-AO-A03P	20	47503054	47733363	3	2
TCGA-AO-A03P	20	47733403	48007784	2	0
TCGA-AO-A03P	20	48009276	49069504	15	2
TCGA-AO-A03P	20	49069753	49460077	3	1
TCGA-AO-A03P	20	49460690	52904267	12	2
TCGA-AO-A03P	20	52904845	53547194	8	2
TCGA-AO-A03P	20	53548676	54150268	24	2
TCGA-AO-A03P	20	54151823	54579547	12	2
TCGA-AO-A03P	20	54579999	55287727	2	0
TCGA-AO-A03P	20	55290158	55631639	13	2
TCGA-AO-A03P	20	55633336	56212516	7	2
TCGA-AO-A03P	20	56217792	56598527	5	2
TCGA-AO-A03P	20	56599785	56976391	15	2
TCGA-AO-A03P	20	56976426	57255061	4	2
TCGA-AO-A03P	20	57255095	57473765	2	0
TCGA-AO-A03P	20	57479473	59236264	8	2
TCGA-AO-A03P	20	59236378	59986158	18	1
TCGA-AO-A03P	20	59986935	60868826	11	2
TCGA-AO-A03P	20	60868828	61631279	7	2
TCGA-AO-A03P	20	61632000	62280406	11	1
TCGA-AO-A03P	20	62283456	62647076	4	2
TCGA-AO-A03P	20	62647433	63107763	2	0
TCGA-AO-A03P	20	63111631	64044656	5	2
TCGA-AO-A03P	20	64047182	64324800	2	0
TCGA-AO-A03P	21	10336543	46677045	2	1
TCGA-AO-A03P	22	15294545	50796027	2	0
TCGA-AO-A03P	X	251810	156004181	2	2
