sample	chr	startpos	endpos	nMajor	nMinor
TCGA-HC-8265-a	1	61735	7467936	1	1
TCGA-HC-8265-a	1	7468609	8336911	2	1
TCGA-HC-8265-a	1	8337743	12198303	1	1
TCGA-HC-8265-a	1	12198378	15917920	2	1
TCGA-HC-8265-a	1	15924050	23194847	1	1
TCGA-HC-8265-a	1	23196132	23677779	3	1
TCGA-HC-8265-a	1	23678023	26358480	2	1
TCGA-HC-8265-a	1	26358699	31370719	1	1
TCGA-HC-8265-a	1	31371818	32923042	2	1
TCGA-HC-8265-a	1	32927745	48551763	1	1
TCGA-HC-8265-a	1	48554121	48869658	2	1
TCGA-HC-8265-a	1	48869925	52878277	1	1
TCGA-HC-8265-a	1	52879235	53353309	2	1
TCGA-HC-8265-a	1	53353354	67934863	1	1
TCGA-HC-8265-a	1	67936234	68581459	2	1
TCGA-HC-8265-a	1	68583300	75932816	1	1
TCGA-HC-8265-a	1	75933202	76798668	2	1
TCGA-HC-8265-a	1	76798756	77083244	1	1
TCGA-HC-8265-a	1	77089796	77794957	2	1
TCGA-HC-8265-a	1	77802506	85318658	1	1
TCGA-HC-8265-a	1	85319972	85742066	2	1
TCGA-HC-8265-a	1	85743051	88397558	1	1
TCGA-HC-8265-a	1	88398010	91348162	2	1
TCGA-HC-8265-a	1	91348752	99760041	1	1
TCGA-HC-8265-a	1	99763945	100798638	2	1
TCGA-HC-8265-a	1	100798792	117360728	1	1
TCGA-HC-8265-a	1	117364076	119072106	2	1
TCGA-HC-8265-a	1	119072209	120858597	3	1
TCGA-HC-8265-a	1	120858603	147293441	1	1
TCGA-HC-8265-a	1	147294814	149015385	2	1
TCGA-HC-8265-a	1	149016109	153009578	1	1
TCGA-HC-8265-a	1	153012136	156015011	2	1
TCGA-HC-8265-a	1	156017008	180263615	1	1
TCGA-HC-8265-a	1	180263755	184397303	2	1
TCGA-HC-8265-a	1	184398030	196977739	1	1
TCGA-HC-8265-a	1	196977900	198585856	2	1
TCGA-HC-8265-a	1	198589362	203686142	1	1
TCGA-HC-8265-a	1	203686615	206958271	2	1
TCGA-HC-8265-a	1	206960691	230944623	1	1
TCGA-HC-8265-a	1	230944867	231594947	2	1
TCGA-HC-8265-a	1	231597188	241236134	1	1
TCGA-HC-8265-a	1	241236213	241667079	2	1
TCGA-HC-8265-a	1	241671009	244623866	3	1
TCGA-HC-8265-a	1	244624513	248930189	1	1
TCGA-HC-8265-a	2	12784	8443948	1	1
TCGA-HC-8265-a	2	8443955	11372439	2	1
TCGA-HC-8265-a	2	11373741	39872241	1	1
TCGA-HC-8265-a	2	39873798	40153372	2	1
TCGA-HC-8265-a	2	40154229	54897401	1	1
TCGA-HC-8265-a	2	54900318	57020968	2	1
TCGA-HC-8265-a	2	57021135	79578331	1	1
TCGA-HC-8265-a	2	79580898	82043327	2	1
TCGA-HC-8265-a	2	82044084	85064706	1	1
TCGA-HC-8265-a	2	85065024	85701241	2	1
TCGA-HC-8265-a	2	85705880	139153802	1	1
TCGA-HC-8265-a	2	139153833	140201734	2	1
TCGA-HC-8265-a	2	140202992	151278301	1	1
TCGA-HC-8265-a	2	151279000	153736257	2	1
TCGA-HC-8265-a	2	153736909	162096255	1	1
TCGA-HC-8265-a	2	162096583	165175113	2	1
TCGA-HC-8265-a	2	165175282	174110914	1	1
TCGA-HC-8265-a	2	174110967	174696076	2	1
TCGA-HC-8265-a	2	174697495	185410040	1	1
TCGA-HC-8265-a	2	185410900	186088609	2	1
TCGA-HC-8265-a	2	186094573	200148554	1	1
TCGA-HC-8265-a	2	200148591	200660316	2	1
TCGA-HC-8265-a	2	200661159	208868618	1	1
TCGA-HC-8265-a	2	208869209	210548263	2	1
TCGA-HC-8265-a	2	210549035	215379109	1	1
TCGA-HC-8265-a	2	215382040	215612254	2	1
TCGA-HC-8265-a	2	215612449	216947182	1	1
TCGA-HC-8265-a	2	216947654	217186104	2	1
TCGA-HC-8265-a	2	217186334	222443685	1	1
TCGA-HC-8265-a	2	222445183	223169183	2	1
TCGA-HC-8265-a	2	223169183	231853432	1	1
TCGA-HC-8265-a	2	231853451	235635067	2	1
TCGA-HC-8265-a	2	235637992	242147305	1	1
TCGA-HC-8265-a	3	18667	25319432	1	1
TCGA-HC-8265-a	3	25320361	26869647	2	1
TCGA-HC-8265-a	3	26870283	31570358	1	1
TCGA-HC-8265-a	3	31578630	36783682	2	1
TCGA-HC-8265-a	3	36784042	47709803	1	1
TCGA-HC-8265-a	3	47711749	49957117	2	1
TCGA-HC-8265-a	3	49960124	66010643	1	1
TCGA-HC-8265-a	3	66011352	68367971	2	1
TCGA-HC-8265-a	3	68372242	90233924	1	1
TCGA-HC-8265-a	3	90234801	94526319	2	1
TCGA-HC-8265-a	3	94529128	96072354	1	1
TCGA-HC-8265-a	3	96073165	99056177	2	1
TCGA-HC-8265-a	3	99058775	125624590	1	1
TCGA-HC-8265-a	3	125627617	129965998	2	1
TCGA-HC-8265-a	3	129966757	151345042	1	1
TCGA-HC-8265-a	3	151346228	152991052	3	1
TCGA-HC-8265-a	3	152993471	154307951	2	1
TCGA-HC-8265-a	3	154309683	171602228	1	1
TCGA-HC-8265-a	3	171602437	175360729	2	1
TCGA-HC-8265-a	3	175362803	187436078	1	1
TCGA-HC-8265-a	3	187436888	190136729	2	1
TCGA-HC-8265-a	3	190144595	198169247	1	1
TCGA-HC-8265-a	4	12281	250572	1	1
TCGA-HC-8265-a	4	254291	1790291	2	1
TCGA-HC-8265-a	4	1791556	3017327	1	1
TCGA-HC-8265-a	4	3022996	3754116	3	1
TCGA-HC-8265-a	4	3754570	6778117	2	1
TCGA-HC-8265-a	4	6784729	13610631	1	1
TCGA-HC-8265-a	4	13610960	14924673	2	1
TCGA-HC-8265-a	4	14925555	23143265	1	1
TCGA-HC-8265-a	4	23143590	24722491	2	1
TCGA-HC-8265-a	4	24722928	48042934	1	1
TCGA-HC-8265-a	4	48042986	49087357	2	1
TCGA-HC-8265-a	4	49091769	54644915	1	1
TCGA-HC-8265-a	4	54644946	55094992	2	1
TCGA-HC-8265-a	4	55096191	56201779	1	1
TCGA-HC-8265-a	4	56203456	57326509	2	1
TCGA-HC-8265-a	4	57326685	124062537	1	1
TCGA-HC-8265-a	4	124064247	126422928	2	1
TCGA-HC-8265-a	4	126423518	142336068	1	1
TCGA-HC-8265-a	4	142336087	145157755	2	1
TCGA-HC-8265-a	4	145159944	147070545	1	1
TCGA-HC-8265-a	4	147072520	147458462	2	1
TCGA-HC-8265-a	4	147458980	151768122	3	1
TCGA-HC-8265-a	4	151768419	152297504	2	1
TCGA-HC-8265-a	4	152298079	154641799	1	1
TCGA-HC-8265-a	4	154642354	155160523	2	1
TCGA-HC-8265-a	4	155162996	162675467	1	1
TCGA-HC-8265-a	4	162675564	163331687	2	1
TCGA-HC-8265-a	4	163334277	163604858	4	1
TCGA-HC-8265-a	4	163605003	165997505	2	1
TCGA-HC-8265-a	4	166002123	173590598	1	1
TCGA-HC-8265-a	4	173592919	175110200	2	1
TCGA-HC-8265-a	4	175114042	176855069	1	1
TCGA-HC-8265-a	4	176855549	178552932	2	1
TCGA-HC-8265-a	4	178553248	190106768	1	1
TCGA-HC-8265-a	5	15532	5078138	1	1
TCGA-HC-8265-a	5	5078200	5414722	2	1
TCGA-HC-8265-a	5	5414826	31316284	1	1
TCGA-HC-8265-a	5	31316485	33794389	2	1
TCGA-HC-8265-a	5	33794650	38379734	1	1
TCGA-HC-8265-a	5	38380198	39577819	2	1
TCGA-HC-8265-a	5	39580726	82396948	1	1
TCGA-HC-8265-a	5	82398075	84024077	2	1
TCGA-HC-8265-a	5	84027031	86668548	1	1
TCGA-HC-8265-a	5	86668875	88545028	2	1
TCGA-HC-8265-a	5	88548084	136681085	1	1
TCGA-HC-8265-a	5	136681322	137699602	2	1
TCGA-HC-8265-a	5	137701580	138304968	3	1
TCGA-HC-8265-a	5	138305777	140273433	2	1
TCGA-HC-8265-a	5	140273623	169814869	1	1
TCGA-HC-8265-a	5	169816838	173297271	2	1
TCGA-HC-8265-a	5	173298333	177982825	1	1
TCGA-HC-8265-a	5	177983415	180688817	2	1
TCGA-HC-8265-a	5	180689271	181363319	1	1
TCGA-HC-8265-a	6	149661	5846488	1	1
TCGA-HC-8265-a	6	5849702	6157375	2	1
TCGA-HC-8265-a	6	6157724	12216270	1	1
TCGA-HC-8265-a	6	12216413	12510694	2	1
TCGA-HC-8265-a	6	12510760	37331337	1	1
TCGA-HC-8265-a	6	37331660	37795030	2	1
TCGA-HC-8265-a	6	37795093	94779895	1	1
TCGA-HC-8265-a	6	94783937	95691229	2	1
TCGA-HC-8265-a	6	95693508	125179110	1	1
TCGA-HC-8265-a	6	125181853	125498917	2	1
TCGA-HC-8265-a	6	125498932	137482774	1	1
TCGA-HC-8265-a	6	137492691	137752552	2	1
TCGA-HC-8265-a	6	137755016	165512597	1	1
TCGA-HC-8265-a	6	165516080	165902550	2	1
TCGA-HC-8265-a	6	165903350	170741917	1	1
TCGA-HC-8265-a	7	43259	14152243	1	1
TCGA-HC-8265-a	7	14156124	15129279	2	1
TCGA-HC-8265-a	7	15132602	17425006	3	2
TCGA-HC-8265-a	7	17425516	42008667	1	1
TCGA-HC-8265-a	7	42010095	42219494	3	1
TCGA-HC-8265-a	7	42221225	73643220	1	1
TCGA-HC-8265-a	7	73650207	76507967	2	1
TCGA-HC-8265-a	7	76508058	95959146	1	1
TCGA-HC-8265-a	7	95960078	96230348	2	1
TCGA-HC-8265-a	7	96230475	124100714	1	1
TCGA-HC-8265-a	7	124101129	125953368	2	1
TCGA-HC-8265-a	7	125959150	137507792	1	1
TCGA-HC-8265-a	7	137510752	138462788	2	1
TCGA-HC-8265-a	7	138467263	139150042	2	2
TCGA-HC-8265-a	7	139153993	142055395	2	1
TCGA-HC-8265-a	7	142057791	148998722	1	1
TCGA-HC-8265-a	7	148998888	151483627	2	1
TCGA-HC-8265-a	7	151487899	159334314	1	1
TCGA-HC-8265-a	8	81254	2595220	1	0
TCGA-HC-8265-a	8	2596026	18513521	1	1
TCGA-HC-8265-a	8	18514075	18827038	2	1
TCGA-HC-8265-a	8	18829426	61149917	1	1
TCGA-HC-8265-a	8	61152479	61720430	2	1
TCGA-HC-8265-a	8	61720506	80183136	1	1
TCGA-HC-8265-a	8	80183160	80878167	2	1
TCGA-HC-8265-a	8	80882662	84539113	1	1
TCGA-HC-8265-a	8	84539688	85430396	3	1
TCGA-HC-8265-a	8	85432979	92180108	1	1
TCGA-HC-8265-a	8	92184543	95564500	2	1
TCGA-HC-8265-a	8	95565078	100045359	1	1
TCGA-HC-8265-a	8	100046283	111156962	2	1
TCGA-HC-8265-a	8	111157443	115087416	4	1
TCGA-HC-8265-a	8	115087951	130223890	2	1
TCGA-HC-8265-a	8	130224775	130657175	3	1
TCGA-HC-8265-a	8	130657813	145072769	2	1
TCGA-HC-8265-a	9	46587	14326304	1	1
TCGA-HC-8265-a	9	14327183	18456955	2	1
TCGA-HC-8265-a	9	18458690	26362566	1	1
TCGA-HC-8265-a	9	26362881	26975599	2	1
TCGA-HC-8265-a	9	26977028	28734250	1	1
TCGA-HC-8265-a	9	28738175	28868212	2	1
TCGA-HC-8265-a	9	28868245	30810535	1	1
TCGA-HC-8265-a	9	30813375	35812626	2	1
TCGA-HC-8265-a	9	35819303	93404297	1	1
TCGA-HC-8265-a	9	93408254	98454435	2	1
TCGA-HC-8265-a	9	98455240	113299411	1	1
TCGA-HC-8265-a	9	113300330	113836923	2	1
TCGA-HC-8265-a	9	113844630	117232336	1	1
TCGA-HC-8265-a	9	117232412	117740741	2	1
TCGA-HC-8265-a	9	117740996	131183498	1	1
TCGA-HC-8265-a	9	131185177	131710351	2	1
TCGA-HC-8265-a	9	131710905	138200944	1	1
TCGA-HC-8265-a	10	26823	5155686	1	1
TCGA-HC-8265-a	10	5155930	7000890	2	1
TCGA-HC-8265-a	10	7003822	15161311	1	1
TCGA-HC-8265-a	10	15161875	18785871	2	1
TCGA-HC-8265-a	10	18789944	60311139	1	1
TCGA-HC-8265-a	10	60315881	65271103	2	1
TCGA-HC-8265-a	10	65271195	81910686	1	1
TCGA-HC-8265-a	10	81911421	82597383	2	1
TCGA-HC-8265-a	10	82601621	89583754	1	1
TCGA-HC-8265-a	10	89584326	89721169	2	1
TCGA-HC-8265-a	10	89723163	133769379	1	1
TCGA-HC-8265-a	11	198572	40061798	1	1
TCGA-HC-8265-a	11	40062105	42825453	2	1
TCGA-HC-8265-a	11	42825943	65474292	1	1
TCGA-HC-8265-a	11	65478583	67654761	2	1
TCGA-HC-8265-a	11	67655887	106773767	1	1
TCGA-HC-8265-a	11	106776785	109269020	2	1
TCGA-HC-8265-a	11	109269440	113906357	1	1
TCGA-HC-8265-a	11	113910328	114321953	2	1
TCGA-HC-8265-a	11	114323620	118003778	1	1
TCGA-HC-8265-a	11	118004456	122963767	2	1
TCGA-HC-8265-a	11	122969024	135074876	1	1
TCGA-HC-8265-a	12	51460	13498147	1	1
TCGA-HC-8265-a	12	13504750	13799372	2	1
TCGA-HC-8265-a	12	13800184	50904979	1	1
TCGA-HC-8265-a	12	50905562	53340722	2	1
TCGA-HC-8265-a	12	53344430	55573218	1	1
TCGA-HC-8265-a	12	55573234	56073803	2	1
TCGA-HC-8265-a	12	56076841	64630839	1	1
TCGA-HC-8265-a	12	64630892	69503847	2	1
TCGA-HC-8265-a	12	69504901	84839362	1	1
TCGA-HC-8265-a	12	84841316	87293424	2	1
TCGA-HC-8265-a	12	87294017	91383730	1	1
TCGA-HC-8265-a	12	91385246	94016117	2	1
TCGA-HC-8265-a	12	94016117	103506653	1	1
TCGA-HC-8265-a	12	103511947	104304425	2	1
TCGA-HC-8265-a	12	104306628	107232963	2	2
TCGA-HC-8265-a	12	107233052	107548827	2	1
TCGA-HC-8265-a	12	107549134	112548127	1	1
TCGA-HC-8265-a	12	112551237	112884751	2	1
TCGA-HC-8265-a	12	112887077	133201603	1	1
TCGA-HC-8265-a	13	18452809	19503064	1	1
TCGA-HC-8265-a	13	19507165	20217943	2	1
TCGA-HC-8265-a	13	20218045	22148335	1	1
TCGA-HC-8265-a	13	22149076	23772073	2	1
TCGA-HC-8265-a	13	23774020	28398356	1	1
TCGA-HC-8265-a	13	28398422	32034895	2	1
TCGA-HC-8265-a	13	32040962	46263679	1	1
TCGA-HC-8265-a	13	46264131	47251900	2	1
TCGA-HC-8265-a	13	47253354	56961413	1	1
TCGA-HC-8265-a	13	56966623	61298548	2	1
TCGA-HC-8265-a	13	61299246	106775817	1	1
TCGA-HC-8265-a	13	106787972	107031443	2	1
TCGA-HC-8265-a	13	107031724	114342922	1	1
TCGA-HC-8265-a	14	18225647	33295741	1	1
TCGA-HC-8265-a	14	33296131	33652941	2	1
TCGA-HC-8265-a	14	33653265	33836389	1	1
TCGA-HC-8265-a	14	33836692	36228937	2	1
TCGA-HC-8265-a	14	36230435	37129301	2	2
TCGA-HC-8265-a	14	37130422	38125431	2	1
TCGA-HC-8265-a	14	38125824	48665954	1	1
TCGA-HC-8265-a	14	48669225	49264087	3	1
TCGA-HC-8265-a	14	49267971	51492937	2	1
TCGA-HC-8265-a	14	51493994	57204047	1	1
TCGA-HC-8265-a	14	57205499	57659039	2	1
TCGA-HC-8265-a	14	57659421	60370519	1	1
TCGA-HC-8265-a	14	60370879	60879577	2	1
TCGA-HC-8265-a	14	60880820	66120262	1	1
TCGA-HC-8265-a	14	66132588	66376420	2	1
TCGA-HC-8265-a	14	66378771	85514180	1	1
TCGA-HC-8265-a	14	85514951	85673709	2	1
TCGA-HC-8265-a	14	85673833	92305861	1	1
TCGA-HC-8265-a	14	92306355	94944192	2	1
TCGA-HC-8265-a	14	94944733	106877229	1	1
TCGA-HC-8265-a	15	19811075	25278979	1	1
TCGA-HC-8265-a	15	25279613	27086478	2	1
TCGA-HC-8265-a	15	27089753	46498435	1	1
TCGA-HC-8265-a	15	46498672	46636154	2	1
TCGA-HC-8265-a	15	46636371	56670314	1	1
TCGA-HC-8265-a	15	56670665	59493201	2	1
TCGA-HC-8265-a	15	59493260	66412111	1	1
TCGA-HC-8265-a	15	66413318	66996316	2	1
TCGA-HC-8265-a	15	66996900	69749055	1	1
TCGA-HC-8265-a	15	69752156	70742158	2	1
TCGA-HC-8265-a	15	70742241	93851191	1	1
TCGA-HC-8265-a	15	93854848	95165104	2	1
TCGA-HC-8265-a	15	95167021	101928837	1	1
TCGA-HC-8265-a	16	10777	8279388	1	1
TCGA-HC-8265-a	16	8279511	13520259	2	1
TCGA-HC-8265-a	16	13521401	69650500	1	1
TCGA-HC-8265-a	16	69655331	70177541	2	1
TCGA-HC-8265-a	16	70179141	73441593	1	1
TCGA-HC-8265-a	16	73441768	73763109	2	1
TCGA-HC-8265-a	16	73764640	74462560	1	1
TCGA-HC-8265-a	16	74464500	75260313	2	1
TCGA-HC-8265-a	16	75260691	77889121	1	1
TCGA-HC-8265-a	16	77889172	90221127	1	0
TCGA-HC-8265-a	17	150733	8027460	1	1
TCGA-HC-8265-a	17	8027481	11389756	2	1
TCGA-HC-8265-a	17	11390401	15233405	1	1
TCGA-HC-8265-a	17	15233680	15561042	2	1
TCGA-HC-8265-a	17	15568913	65023923	1	1
TCGA-HC-8265-a	17	65029025	68937792	2	1
TCGA-HC-8265-a	17	68941120	83090856	1	1
TCGA-HC-8265-a	18	48133	3457246	1	1
TCGA-HC-8265-a	18	3459380	5012434	2	1
TCGA-HC-8265-a	18	5012918	26016378	1	1
TCGA-HC-8265-a	18	26024622	26792628	2	2
TCGA-HC-8265-a	18	26796443	28924418	2	1
TCGA-HC-8265-a	18	28925272	37053416	1	1
TCGA-HC-8265-a	18	37055643	37349136	2	1
TCGA-HC-8265-a	18	37349501	73046100	1	1
TCGA-HC-8265-a	18	73046394	73612790	2	1
TCGA-HC-8265-a	18	73614958	80257174	1	1
TCGA-HC-8265-a	19	90910	13877018	1	1
TCGA-HC-8265-a	19	13881144	16768895	2	1
TCGA-HC-8265-a	19	16773101	27290048	1	1
TCGA-HC-8265-a	19	27290383	28510729	2	1
TCGA-HC-8265-a	19	28511384	35178356	1	1
TCGA-HC-8265-a	19	35178750	35706863	2	1
TCGA-HC-8265-a	19	35710338	47744444	1	1
TCGA-HC-8265-a	19	47747063	49557854	2	1
TCGA-HC-8265-a	19	49558134	52530158	1	1
TCGA-HC-8265-a	19	52530843	52793217	2	1
TCGA-HC-8265-a	19	52793649	54100903	1	1
TCGA-HC-8265-a	19	54101539	55836671	2	1
TCGA-HC-8265-a	19	55836697	58586487	1	1
TCGA-HC-8265-a	20	80664	31389146	1	1
TCGA-HC-8265-a	20	31390958	34368346	2	1
TCGA-HC-8265-a	20	34384272	53455313	1	1
TCGA-HC-8265-a	20	53463969	54466640	2	1
TCGA-HC-8265-a	20	54467357	61915030	1	1
TCGA-HC-8265-a	20	61915285	64009933	2	1
TCGA-HC-8265-a	20	64010704	64324800	1	1
TCGA-HC-8265-a	21	10336543	34557891	1	1
TCGA-HC-8265-a	21	34559838	35004563	2	1
TCGA-HC-8265-a	21	35004842	46677045	1	1
TCGA-HC-8265-a	22	15294545	19451897	1	1
TCGA-HC-8265-a	22	19456408	22770258	2	1
TCGA-HC-8265-a	22	22770599	26188649	1	1
TCGA-HC-8265-a	22	26190829	26747282	2	1
TCGA-HC-8265-a	22	26748107	33412439	1	1
TCGA-HC-8265-a	22	33413443	33567804	2	1
TCGA-HC-8265-a	22	33568590	50796027	1	1
TCGA-HC-8265-a	X	251810	1479705	2	1
TCGA-HC-8265-a	X	1480942	2776199	3	1
TCGA-HC-8265-a	X	2785350	15056063	1	0
TCGA-HC-8265-a	X	15057320	19125801	2	0
TCGA-HC-8265-a	X	19127408	30405674	1	0
TCGA-HC-8265-a	X	30406469	32236435	2	0
TCGA-HC-8265-a	X	32236463	71748442	1	0
TCGA-HC-8265-a	X	71756533	72565383	2	0
TCGA-HC-8265-a	X	72573121	136507291	1	0
TCGA-HC-8265-a	X	136507868	138800535	2	0
TCGA-HC-8265-a	X	138811533	155699837	1	0
TCGA-HC-8265-a	X	155733777	156004181	4	0
